Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF17Q02223 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms