Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
XPCQ01831 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
XPCQ01831 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
XPCQ01831 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
XPCQ01831 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
XPCQ01831 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
XPCQ01831 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
XPCQ01831 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
XPCQ01831 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
XPCQ01831 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
XPCQ01831 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
XPCQ01831 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
XPCQ01831 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
XPCQ01831 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
XPCQ01831 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
XPCQ01831 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
XPCQ01831 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
XPCQ01831 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
XPCQ01831 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
XPCQ01831 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
XPCQ01831 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
XPCQ01831 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
XPCQ01831 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
XPCQ01831 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
XPCQ01831 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
XPCQ01831 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
XPCQ01831 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
XPCQ01831 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
XPCQ01831 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
XPCQ01831 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
XPCQ01831 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
XPCQ01831 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
XPCQ01831 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
XPCQ01831 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
XPCQ01831 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
XPCQ01831 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
XPCQ01831 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
XPCQ01831 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
XPCQ01831 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
XPCQ01831 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
XPCQ01831 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
XPCQ01831 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
XPCQ01831 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
XPCQ01831 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
XPCQ01831 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
XPCQ01831 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
XPCQ01831 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
XPCQ01831 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
XPCQ01831 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
XPCQ01831 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
XPCQ01831 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
XPCQ01831 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
XPCQ01831 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
XPCQ01831 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
XPCQ01831 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
XPCQ01831 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
XPCQ01831 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
XPCQ01831 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
XPCQ01831 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
XPCQ01831 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
XPCQ01831 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
XPCQ01831 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
XPCQ01831 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
XPCQ01831 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
XPCQ01831 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
XPCQ01831 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
XPCQ01831 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
XPCQ01831 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
XPCQ01831 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
XPCQ01831 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
XPCQ01831 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
XPCQ01831 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
XPCQ01831 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
XPCQ01831 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
XPCQ01831 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
XPCQ01831 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
XPCQ01831 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
XPCQ01831 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
XPCQ01831 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
XPCQ01831 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
XPCQ01831 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
XPCQ01831 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
XPCQ01831 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
XPCQ01831 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
XPCQ01831 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
XPCQ01831 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
XPCQ01831 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
XPCQ01831 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
XPCQ01831 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
XPCQ01831 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
XPCQ01831 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
XPCQ01831 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
XPCQ01831 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
XPCQ01831 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
XPCQ01831 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
XPCQ01831 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
XPCQ01831 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
XPCQ01831 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
XPCQ01831 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
XPCQ01831 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms