Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A2Q01362 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms