Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDLBPQ00341 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDLBPQ00341 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HDLBPQ00341 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms