Protein–RNA interactions for Protein: P98187

CYP4F8, Cytochrome P450 4F8, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F8P98187 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F8P98187 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4F8P98187 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F8P98187 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F8P98187 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F8P98187 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F8P98187 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F8P98187 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F8P98187 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms