Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD3P84022 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD3P84022 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms