Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PITX1P78337 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PITX1P78337 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PITX1P78337 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITX1P78337 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PITX1P78337 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITX1P78337 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITX1P78337 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PITX1P78337 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITX1P78337 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITX1P78337 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITX1P78337 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITX1P78337 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITX1P78337 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITX1P78337 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITX1P78337 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PITX1P78337 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITX1P78337 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITX1P78337 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITX1P78337 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITX1P78337 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITX1P78337 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PITX1P78337 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PITX1P78337 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PITX1P78337 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITX1P78337 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PITX1P78337 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITX1P78337 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITX1P78337 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITX1P78337 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITX1P78337 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITX1P78337 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITX1P78337 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITX1P78337 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITX1P78337 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PITX1P78337 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PITX1P78337 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PITX1P78337 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PITX1P78337 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PITX1P78337 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PITX1P78337 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PITX1P78337 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PITX1P78337 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PITX1P78337 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PITX1P78337 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITX1P78337 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITX1P78337 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITX1P78337 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITX1P78337 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITX1P78337 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITX1P78337 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITX1P78337 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITX1P78337 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITX1P78337 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITX1P78337 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITX1P78337 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITX1P78337 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITX1P78337 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITX1P78337 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITX1P78337 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PITX1P78337 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PITX1P78337 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PITX1P78337 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PITX1P78337 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PITX1P78337 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PITX1P78337 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PITX1P78337 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PITX1P78337 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PITX1P78337 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PITX1P78337 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITX1P78337 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITX1P78337 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITX1P78337 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITX1P78337 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITX1P78337 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITX1P78337 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITX1P78337 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITX1P78337 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITX1P78337 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITX1P78337 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITX1P78337 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PITX1P78337 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PITX1P78337 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PITX1P78337 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PITX1P78337 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PITX1P78337 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PITX1P78337 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PITX1P78337 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PITX1P78337 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PITX1P78337 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PITX1P78337 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PITX1P78337 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PITX1P78337 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PITX1P78337 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PITX1P78337 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PITX1P78337 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PITX1P78337 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PITX1P78337 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PITX1P78337 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PITX1P78337 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms