Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2P78314 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2P78314 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms