Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA4AP68366 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms