Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPD1P62314 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPD1P62314 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPD1P62314 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPD1P62314 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPD1P62314 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPD1P62314 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPD1P62314 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPD1P62314 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPD1P62314 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPD1P62314 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPD1P62314 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPD1P62314 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPD1P62314 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNRPD1P62314 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPD1P62314 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms