Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVK-21P61565 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-21P61565 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-21P61565 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms