Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH8P55286 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH8P55286 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH8P55286 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH8P55286 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH8P55286 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH8P55286 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH8P55286 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH8P55286 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH8P55286 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH8P55286 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH8P55286 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH8P55286 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH8P55286 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH8P55286 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH8P55286 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH8P55286 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH8P55286 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH8P55286 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH8P55286 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH8P55286 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH8P55286 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH8P55286 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH8P55286 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH8P55286 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH8P55286 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH8P55286 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH8P55286 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH8P55286 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH8P55286 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH8P55286 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH8P55286 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH8P55286 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH8P55286 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH8P55286 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH8P55286 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDH8P55286 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH8P55286 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH8P55286 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH8P55286 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH8P55286 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH8P55286 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH8P55286 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH8P55286 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH8P55286 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH8P55286 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH8P55286 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH8P55286 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH8P55286 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH8P55286 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH8P55286 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH8P55286 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH8P55286 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH8P55286 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH8P55286 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH8P55286 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH8P55286 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH8P55286 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH8P55286 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH8P55286 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH8P55286 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH8P55286 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH8P55286 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH8P55286 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH8P55286 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CDH8P55286 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH8P55286 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH8P55286 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH8P55286 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH8P55286 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH8P55286 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH8P55286 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH8P55286 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH8P55286 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH8P55286 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH8P55286 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH8P55286 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH8P55286 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH8P55286 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH8P55286 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH8P55286 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH8P55286 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH8P55286 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH8P55286 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH8P55286 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH8P55286 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH8P55286 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH8P55286 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH8P55286 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH8P55286 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH8P55286 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH8P55286 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH8P55286 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH8P55286 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH8P55286 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH8P55286 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH8P55286 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH8P55286 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH8P55286 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH8P55286 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms