Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMP1P54849 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMP1P54849 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMP1P54849 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMP1P54849 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMP1P54849 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMP1P54849 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMP1P54849 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMP1P54849 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMP1P54849 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMP1P54849 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMP1P54849 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMP1P54849 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMP1P54849 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMP1P54849 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMP1P54849 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMP1P54849 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMP1P54849 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMP1P54849 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMP1P54849 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMP1P54849 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMP1P54849 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMP1P54849 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMP1P54849 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EMP1P54849 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMP1P54849 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMP1P54849 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMP1P54849 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMP1P54849 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMP1P54849 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMP1P54849 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EMP1P54849 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EMP1P54849 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMP1P54849 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMP1P54849 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMP1P54849 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMP1P54849 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMP1P54849 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMP1P54849 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMP1P54849 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMP1P54849 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMP1P54849 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMP1P54849 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMP1P54849 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMP1P54849 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMP1P54849 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMP1P54849 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMP1P54849 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMP1P54849 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMP1P54849 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMP1P54849 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EMP1P54849 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMP1P54849 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMP1P54849 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMP1P54849 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMP1P54849 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMP1P54849 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMP1P54849 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMP1P54849 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMP1P54849 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMP1P54849 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMP1P54849 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMP1P54849 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMP1P54849 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMP1P54849 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMP1P54849 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EMP1P54849 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMP1P54849 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMP1P54849 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMP1P54849 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMP1P54849 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMP1P54849 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMP1P54849 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMP1P54849 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMP1P54849 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EMP1P54849 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMP1P54849 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EMP1P54849 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMP1P54849 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMP1P54849 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EMP1P54849 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EMP1P54849 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EMP1P54849 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EMP1P54849 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMP1P54849 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMP1P54849 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EMP1P54849 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EMP1P54849 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMP1P54849 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMP1P54849 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMP1P54849 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMP1P54849 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMP1P54849 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMP1P54849 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMP1P54849 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMP1P54849 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMP1P54849 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMP1P54849 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMP1P54849 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EMP1P54849 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms