Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB28P51157 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB28P51157 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB28P51157 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB28P51157 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB28P51157 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB28P51157 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB28P51157 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB28P51157 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB28P51157 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB28P51157 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB28P51157 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB28P51157 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB28P51157 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB28P51157 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB28P51157 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB28P51157 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB28P51157 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB28P51157 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB28P51157 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB28P51157 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB28P51157 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB28P51157 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB28P51157 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB28P51157 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB28P51157 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB28P51157 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB28P51157 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB28P51157 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB28P51157 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB28P51157 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB28P51157 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB28P51157 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB28P51157 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB28P51157 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB28P51157 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB28P51157 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB28P51157 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB28P51157 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB28P51157 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB28P51157 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB28P51157 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB28P51157 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB28P51157 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB28P51157 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB28P51157 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB28P51157 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB28P51157 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB28P51157 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB28P51157 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB28P51157 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB28P51157 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB28P51157 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB28P51157 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB28P51157 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB28P51157 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB28P51157 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB28P51157 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB28P51157 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB28P51157 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB28P51157 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB28P51157 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB28P51157 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB28P51157 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB28P51157 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB28P51157 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB28P51157 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB28P51157 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB28P51157 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB28P51157 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB28P51157 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB28P51157 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB28P51157 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB28P51157 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB28P51157 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB28P51157 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB28P51157 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB28P51157 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB28P51157 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB28P51157 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB28P51157 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB28P51157 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB28P51157 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB28P51157 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB28P51157 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB28P51157 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB28P51157 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB28P51157 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB28P51157 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB28P51157 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB28P51157 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB28P51157 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB28P51157 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB28P51157 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB28P51157 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB28P51157 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB28P51157 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB28P51157 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB28P51157 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB28P51157 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms