Protein–RNA interactions for Protein: P50336

PPOX, Protoporphyrinogen oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPOXP50336 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPOXP50336 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPOXP50336 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPOXP50336 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPOXP50336 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPOXP50336 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPOXP50336 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPOXP50336 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPOXP50336 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPOXP50336 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPOXP50336 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPOXP50336 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPOXP50336 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPOXP50336 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPOXP50336 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPOXP50336 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPOXP50336 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPOXP50336 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPOXP50336 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPOXP50336 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPOXP50336 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPOXP50336 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPOXP50336 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PPOXP50336 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPOXP50336 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPOXP50336 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPOXP50336 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPOXP50336 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPOXP50336 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPOXP50336 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPOXP50336 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPOXP50336 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPOXP50336 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPOXP50336 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPOXP50336 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPOXP50336 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPOXP50336 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPOXP50336 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPOXP50336 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPOXP50336 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPOXP50336 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPOXP50336 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PPOXP50336 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPOXP50336 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPOXP50336 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPOXP50336 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PPOXP50336 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPOXP50336 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPOXP50336 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPOXP50336 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPOXP50336 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPOXP50336 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPOXP50336 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPOXP50336 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PPOXP50336 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PPOXP50336 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPOXP50336 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPOXP50336 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPOXP50336 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPOXP50336 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPOXP50336 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPOXP50336 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPOXP50336 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPOXP50336 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPOXP50336 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPOXP50336 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPOXP50336 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPOXP50336 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PPOXP50336 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPOXP50336 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPOXP50336 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PPOXP50336 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PPOXP50336 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPOXP50336 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPOXP50336 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPOXP50336 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPOXP50336 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPOXP50336 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPOXP50336 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPOXP50336 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPOXP50336 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPOXP50336 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPOXP50336 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPOXP50336 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPOXP50336 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPOXP50336 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPOXP50336 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPOXP50336 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPOXP50336 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPOXP50336 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPOXP50336 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPOXP50336 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PPOXP50336 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPOXP50336 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPOXP50336 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPOXP50336 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPOXP50336 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPOXP50336 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PPOXP50336 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPOXP50336 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms