Protein–RNA interactions for Protein: P50053

KHK, Ketohexokinase, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHKP50053 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHKP50053 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHKP50053 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHKP50053 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHKP50053 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHKP50053 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHKP50053 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KHKP50053 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHKP50053 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHKP50053 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHKP50053 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KHKP50053 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHKP50053 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHKP50053 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHKP50053 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHKP50053 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHKP50053 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KHKP50053 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHKP50053 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHKP50053 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHKP50053 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHKP50053 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHKP50053 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHKP50053 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHKP50053 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHKP50053 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHKP50053 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHKP50053 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHKP50053 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KHKP50053 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHKP50053 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KHKP50053 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KHKP50053 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHKP50053 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHKP50053 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHKP50053 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHKP50053 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHKP50053 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHKP50053 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHKP50053 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHKP50053 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHKP50053 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KHKP50053 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHKP50053 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHKP50053 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KHKP50053 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHKP50053 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHKP50053 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHKP50053 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KHKP50053 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KHKP50053 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KHKP50053 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KHKP50053 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KHKP50053 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KHKP50053 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHKP50053 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHKP50053 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHKP50053 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHKP50053 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHKP50053 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHKP50053 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHKP50053 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHKP50053 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHKP50053 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHKP50053 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHKP50053 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHKP50053 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHKP50053 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHKP50053 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHKP50053 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHKP50053 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KHKP50053 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KHKP50053 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KHKP50053 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KHKP50053 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHKP50053 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHKP50053 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHKP50053 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHKP50053 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHKP50053 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHKP50053 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHKP50053 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHKP50053 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHKP50053 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHKP50053 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHKP50053 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KHKP50053 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHKP50053 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHKP50053 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHKP50053 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHKP50053 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHKP50053 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHKP50053 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KHKP50053 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KHKP50053 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHKP50053 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KHKP50053 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHKP50053 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHKP50053 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHKP50053 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms