Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUMBP49757 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUMBP49757 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUMBP49757 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUMBP49757 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NUMBP49757 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUMBP49757 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUMBP49757 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUMBP49757 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUMBP49757 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUMBP49757 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUMBP49757 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUMBP49757 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUMBP49757 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUMBP49757 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUMBP49757 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUMBP49757 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUMBP49757 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUMBP49757 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUMBP49757 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUMBP49757 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUMBP49757 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUMBP49757 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUMBP49757 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUMBP49757 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUMBP49757 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUMBP49757 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUMBP49757 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUMBP49757 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUMBP49757 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUMBP49757 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUMBP49757 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUMBP49757 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUMBP49757 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUMBP49757 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NUMBP49757 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUMBP49757 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUMBP49757 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUMBP49757 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUMBP49757 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUMBP49757 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUMBP49757 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUMBP49757 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUMBP49757 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUMBP49757 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUMBP49757 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NUMBP49757 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUMBP49757 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUMBP49757 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUMBP49757 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUMBP49757 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUMBP49757 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUMBP49757 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUMBP49757 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUMBP49757 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUMBP49757 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUMBP49757 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUMBP49757 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUMBP49757 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUMBP49757 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUMBP49757 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUMBP49757 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUMBP49757 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUMBP49757 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUMBP49757 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUMBP49757 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUMBP49757 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUMBP49757 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUMBP49757 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUMBP49757 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUMBP49757 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUMBP49757 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUMBP49757 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUMBP49757 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUMBP49757 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUMBP49757 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUMBP49757 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUMBP49757 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUMBP49757 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUMBP49757 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUMBP49757 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUMBP49757 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUMBP49757 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUMBP49757 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUMBP49757 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUMBP49757 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUMBP49757 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUMBP49757 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUMBP49757 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUMBP49757 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUMBP49757 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUMBP49757 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NUMBP49757 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUMBP49757 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUMBP49757 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUMBP49757 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUMBP49757 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUMBP49757 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUMBP49757 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUMBP49757 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms