Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms