Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK1EP49674 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms