Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK8P49336 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK8P49336 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK8P49336 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK8P49336 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK8P49336 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK8P49336 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK8P49336 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK8P49336 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK8P49336 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK8P49336 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK8P49336 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK8P49336 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK8P49336 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK8P49336 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK8P49336 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK8P49336 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK8P49336 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK8P49336 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK8P49336 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK8P49336 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK8P49336 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK8P49336 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK8P49336 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK8P49336 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK8P49336 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK8P49336 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK8P49336 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK8P49336 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK8P49336 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK8P49336 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK8P49336 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK8P49336 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK8P49336 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK8P49336 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK8P49336 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK8P49336 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK8P49336 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK8P49336 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK8P49336 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK8P49336 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK8P49336 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CDK8P49336 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CDK8P49336 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK8P49336 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK8P49336 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK8P49336 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK8P49336 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK8P49336 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK8P49336 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK8P49336 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK8P49336 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK8P49336 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK8P49336 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK8P49336 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK8P49336 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK8P49336 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK8P49336 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK8P49336 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK8P49336 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK8P49336 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK8P49336 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK8P49336 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK8P49336 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK8P49336 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK8P49336 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK8P49336 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK8P49336 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK8P49336 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK8P49336 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK8P49336 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK8P49336 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK8P49336 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK8P49336 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK8P49336 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CDK8P49336 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK8P49336 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK8P49336 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK8P49336 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK8P49336 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK8P49336 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK8P49336 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK8P49336 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK8P49336 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK8P49336 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK8P49336 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK8P49336 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK8P49336 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK8P49336 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK8P49336 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK8P49336 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK8P49336 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK8P49336 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK8P49336 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK8P49336 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK8P49336 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK8P49336 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK8P49336 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK8P49336 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK8P49336 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms