Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PITPNBP48739 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PITPNBP48739 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms