Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMUP48645 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMUP48645 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMUP48645 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMUP48645 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMUP48645 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMUP48645 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMUP48645 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMUP48645 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMUP48645 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NMUP48645 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMUP48645 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMUP48645 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMUP48645 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMUP48645 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMUP48645 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMUP48645 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMUP48645 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMUP48645 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMUP48645 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMUP48645 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMUP48645 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMUP48645 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMUP48645 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMUP48645 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMUP48645 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMUP48645 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMUP48645 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMUP48645 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMUP48645 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMUP48645 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMUP48645 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMUP48645 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMUP48645 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMUP48645 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMUP48645 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMUP48645 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMUP48645 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMUP48645 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMUP48645 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMUP48645 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMUP48645 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMUP48645 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMUP48645 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NMUP48645 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMUP48645 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMUP48645 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NMUP48645 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMUP48645 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMUP48645 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMUP48645 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMUP48645 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMUP48645 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMUP48645 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMUP48645 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMUP48645 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMUP48645 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMUP48645 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMUP48645 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMUP48645 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMUP48645 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMUP48645 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMUP48645 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMUP48645 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMUP48645 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMUP48645 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMUP48645 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMUP48645 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NMUP48645 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMUP48645 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMUP48645 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMUP48645 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMUP48645 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMUP48645 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMUP48645 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMUP48645 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMUP48645 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NMUP48645 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMUP48645 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMUP48645 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMUP48645 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMUP48645 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMUP48645 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMUP48645 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMUP48645 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NMUP48645 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMUP48645 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMUP48645 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMUP48645 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMUP48645 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMUP48645 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMUP48645 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMUP48645 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMUP48645 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMUP48645 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMUP48645 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMUP48645 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMUP48645 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMUP48645 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMUP48645 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms