Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFMP43652 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFMP43652 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFMP43652 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFMP43652 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFMP43652 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFMP43652 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFMP43652 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFMP43652 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFMP43652 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFMP43652 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFMP43652 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFMP43652 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFMP43652 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFMP43652 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFMP43652 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFMP43652 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFMP43652 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFMP43652 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFMP43652 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFMP43652 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFMP43652 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFMP43652 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AFMP43652 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AFMP43652 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AFMP43652 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AFMP43652 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AFMP43652 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AFMP43652 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AFMP43652 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AFMP43652 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFMP43652 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFMP43652 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AFMP43652 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFMP43652 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFMP43652 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
AFMP43652 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
AFMP43652 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AFMP43652 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AFMP43652 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AFMP43652 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFMP43652 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFMP43652 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFMP43652 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFMP43652 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFMP43652 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFMP43652 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFMP43652 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFMP43652 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFMP43652 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFMP43652 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFMP43652 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFMP43652 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFMP43652 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFMP43652 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFMP43652 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFMP43652 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFMP43652 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFMP43652 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFMP43652 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFMP43652 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFMP43652 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFMP43652 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFMP43652 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFMP43652 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFMP43652 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFMP43652 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFMP43652 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFMP43652 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFMP43652 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFMP43652 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFMP43652 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFMP43652 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFMP43652 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFMP43652 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFMP43652 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFMP43652 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFMP43652 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFMP43652 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFMP43652 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFMP43652 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFMP43652 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFMP43652 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFMP43652 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFMP43652 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFMP43652 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFMP43652 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFMP43652 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
AFMP43652 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
AFMP43652 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AFMP43652 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AFMP43652 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AFMP43652 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
AFMP43652 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
AFMP43652 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AFMP43652 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AFMP43652 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AFMP43652 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AFMP43652 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFMP43652 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms