Protein–RNA interactions for Protein: P43308

SSR2, Translocon-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR2P43308 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR2P43308 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR2P43308 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR2P43308 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR2P43308 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR2P43308 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR2P43308 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR2P43308 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR2P43308 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR2P43308 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR2P43308 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR2P43308 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR2P43308 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR2P43308 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR2P43308 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR2P43308 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR2P43308 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR2P43308 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR2P43308 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR2P43308 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR2P43308 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR2P43308 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR2P43308 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR2P43308 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR2P43308 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR2P43308 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR2P43308 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR2P43308 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR2P43308 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR2P43308 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR2P43308 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR2P43308 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR2P43308 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR2P43308 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR2P43308 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR2P43308 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR2P43308 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR2P43308 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR2P43308 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR2P43308 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR2P43308 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR2P43308 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR2P43308 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR2P43308 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSR2P43308 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSR2P43308 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSR2P43308 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSR2P43308 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR2P43308 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR2P43308 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR2P43308 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR2P43308 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR2P43308 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR2P43308 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR2P43308 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR2P43308 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR2P43308 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR2P43308 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR2P43308 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR2P43308 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR2P43308 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR2P43308 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR2P43308 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR2P43308 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR2P43308 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR2P43308 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR2P43308 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR2P43308 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR2P43308 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR2P43308 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR2P43308 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR2P43308 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR2P43308 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR2P43308 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR2P43308 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR2P43308 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR2P43308 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR2P43308 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR2P43308 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR2P43308 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR2P43308 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR2P43308 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR2P43308 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR2P43308 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR2P43308 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR2P43308 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR2P43308 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR2P43308 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR2P43308 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR2P43308 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR2P43308 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR2P43308 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR2P43308 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR2P43308 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR2P43308 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR2P43308 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR2P43308 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR2P43308 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR2P43308 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR2P43308 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms