Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGER3P43115 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER3P43115 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms