Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A1P43005 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A1P43005 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms