Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIA1P42261 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms