Protein–RNA interactions for Protein: P41597

CCR2, C-C chemokine receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR2P41597 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCR2P41597 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCR2P41597 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCR2P41597 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCR2P41597 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCR2P41597 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCR2P41597 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCR2P41597 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCR2P41597 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCR2P41597 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCR2P41597 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCR2P41597 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCR2P41597 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCR2P41597 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR2P41597 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR2P41597 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR2P41597 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR2P41597 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR2P41597 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR2P41597 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR2P41597 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR2P41597 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR2P41597 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR2P41597 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR2P41597 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR2P41597 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR2P41597 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR2P41597 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR2P41597 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR2P41597 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR2P41597 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR2P41597 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR2P41597 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR2P41597 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR2P41597 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR2P41597 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR2P41597 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR2P41597 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR2P41597 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR2P41597 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR2P41597 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR2P41597 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR2P41597 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR2P41597 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR2P41597 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR2P41597 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR2P41597 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR2P41597 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR2P41597 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR2P41597 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCR2P41597 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCR2P41597 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCR2P41597 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCR2P41597 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCR2P41597 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR2P41597 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR2P41597 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR2P41597 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR2P41597 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR2P41597 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR2P41597 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR2P41597 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR2P41597 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR2P41597 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR2P41597 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR2P41597 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR2P41597 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR2P41597 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR2P41597 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCR2P41597 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCR2P41597 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCR2P41597 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCR2P41597 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR2P41597 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR2P41597 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR2P41597 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR2P41597 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR2P41597 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR2P41597 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR2P41597 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR2P41597 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR2P41597 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR2P41597 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR2P41597 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR2P41597 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR2P41597 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR2P41597 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR2P41597 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR2P41597 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR2P41597 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR2P41597 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR2P41597 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR2P41597 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR2P41597 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR2P41597 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR2P41597 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR2P41597 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR2P41597 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR2P41597 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR2P41597 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.9 ms