Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETV3P41162 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETV3P41162 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETV3P41162 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETV3P41162 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ETV3P41162 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETV3P41162 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETV3P41162 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETV3P41162 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETV3P41162 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETV3P41162 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETV3P41162 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETV3P41162 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETV3P41162 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETV3P41162 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETV3P41162 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETV3P41162 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETV3P41162 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETV3P41162 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETV3P41162 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETV3P41162 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETV3P41162 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETV3P41162 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETV3P41162 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETV3P41162 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETV3P41162 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ETV3P41162 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ETV3P41162 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ETV3P41162 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETV3P41162 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETV3P41162 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETV3P41162 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETV3P41162 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETV3P41162 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV3P41162 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV3P41162 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV3P41162 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV3P41162 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV3P41162 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV3P41162 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV3P41162 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ETV3P41162 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ETV3P41162 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ETV3P41162 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ETV3P41162 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ETV3P41162 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ETV3P41162 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV3P41162 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV3P41162 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV3P41162 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV3P41162 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV3P41162 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV3P41162 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV3P41162 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV3P41162 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ETV3P41162 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ETV3P41162 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ETV3P41162 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ETV3P41162 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ETV3P41162 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ETV3P41162 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ETV3P41162 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ETV3P41162 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ETV3P41162 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ETV3P41162 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ETV3P41162 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ETV3P41162 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ETV3P41162 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ETV3P41162 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ETV3P41162 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ETV3P41162 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ETV3P41162 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ETV3P41162 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ETV3P41162 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ETV3P41162 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ETV3P41162 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ETV3P41162 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ETV3P41162 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ETV3P41162 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ETV3P41162 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ETV3P41162 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ETV3P41162 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ETV3P41162 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ETV3P41162 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ETV3P41162 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ETV3P41162 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ETV3P41162 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ETV3P41162 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ETV3P41162 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ETV3P41162 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ETV3P41162 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ETV3P41162 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ETV3P41162 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ETV3P41162 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ETV3P41162 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ETV3P41162 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ETV3P41162 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ETV3P41162 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ETV3P41162 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ETV3P41162 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms