Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VHLP40337 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VHLP40337 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VHLP40337 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VHLP40337 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VHLP40337 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VHLP40337 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VHLP40337 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VHLP40337 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VHLP40337 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VHLP40337 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VHLP40337 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VHLP40337 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VHLP40337 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VHLP40337 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VHLP40337 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VHLP40337 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VHLP40337 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VHLP40337 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VHLP40337 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VHLP40337 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VHLP40337 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VHLP40337 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VHLP40337 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VHLP40337 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VHLP40337 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VHLP40337 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VHLP40337 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VHLP40337 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VHLP40337 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VHLP40337 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VHLP40337 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VHLP40337 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VHLP40337 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VHLP40337 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VHLP40337 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VHLP40337 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VHLP40337 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VHLP40337 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VHLP40337 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VHLP40337 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VHLP40337 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VHLP40337 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VHLP40337 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VHLP40337 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VHLP40337 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VHLP40337 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VHLP40337 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VHLP40337 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VHLP40337 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VHLP40337 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VHLP40337 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VHLP40337 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VHLP40337 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VHLP40337 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VHLP40337 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VHLP40337 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VHLP40337 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VHLP40337 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VHLP40337 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VHLP40337 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VHLP40337 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VHLP40337 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VHLP40337 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VHLP40337 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VHLP40337 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VHLP40337 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VHLP40337 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VHLP40337 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VHLP40337 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VHLP40337 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VHLP40337 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VHLP40337 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VHLP40337 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VHLP40337 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VHLP40337 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VHLP40337 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VHLP40337 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VHLP40337 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VHLP40337 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VHLP40337 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VHLP40337 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VHLP40337 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VHLP40337 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VHLP40337 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VHLP40337 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VHLP40337 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VHLP40337 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VHLP40337 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VHLP40337 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VHLP40337 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VHLP40337 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VHLP40337 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VHLP40337 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VHLP40337 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VHLP40337 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VHLP40337 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VHLP40337 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VHLP40337 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VHLP40337 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms