Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THPOP40225 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THPOP40225 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THPOP40225 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THPOP40225 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THPOP40225 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
THPOP40225 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THPOP40225 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THPOP40225 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THPOP40225 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THPOP40225 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THPOP40225 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THPOP40225 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THPOP40225 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THPOP40225 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THPOP40225 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THPOP40225 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THPOP40225 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
THPOP40225 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THPOP40225 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THPOP40225 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THPOP40225 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
THPOP40225 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THPOP40225 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THPOP40225 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
THPOP40225 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
THPOP40225 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
THPOP40225 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
THPOP40225 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THPOP40225 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
THPOP40225 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
THPOP40225 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
THPOP40225 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THPOP40225 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
THPOP40225 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THPOP40225 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
THPOP40225 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
THPOP40225 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THPOP40225 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THPOP40225 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THPOP40225 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THPOP40225 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THPOP40225 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THPOP40225 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THPOP40225 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THPOP40225 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THPOP40225 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
THPOP40225 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
THPOP40225 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THPOP40225 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THPOP40225 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THPOP40225 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
THPOP40225 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THPOP40225 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THPOP40225 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THPOP40225 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THPOP40225 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THPOP40225 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THPOP40225 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THPOP40225 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THPOP40225 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
THPOP40225 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THPOP40225 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
THPOP40225 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THPOP40225 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THPOP40225 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
THPOP40225 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
THPOP40225 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THPOP40225 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THPOP40225 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THPOP40225 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THPOP40225 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THPOP40225 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THPOP40225 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THPOP40225 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THPOP40225 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THPOP40225 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THPOP40225 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
THPOP40225 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
THPOP40225 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
THPOP40225 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THPOP40225 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THPOP40225 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THPOP40225 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
THPOP40225 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
THPOP40225 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THPOP40225 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
THPOP40225 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
THPOP40225 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
THPOP40225 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
THPOP40225 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THPOP40225 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
THPOP40225 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
THPOP40225 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THPOP40225 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
THPOP40225 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THPOP40225 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
THPOP40225 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
THPOP40225 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THPOP40225 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms