Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP62P37198 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP62P37198 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP62P37198 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP62P37198 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP62P37198 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP62P37198 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP62P37198 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP62P37198 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP62P37198 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP62P37198 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP62P37198 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP62P37198 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP62P37198 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP62P37198 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP62P37198 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP62P37198 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP62P37198 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP62P37198 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP62P37198 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP62P37198 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP62P37198 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP62P37198 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP62P37198 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP62P37198 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP62P37198 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP62P37198 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP62P37198 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP62P37198 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP62P37198 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP62P37198 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP62P37198 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP62P37198 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP62P37198 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP62P37198 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP62P37198 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP62P37198 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUP62P37198 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP62P37198 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP62P37198 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP62P37198 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP62P37198 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP62P37198 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP62P37198 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP62P37198 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP62P37198 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP62P37198 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP62P37198 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP62P37198 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP62P37198 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP62P37198 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP62P37198 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP62P37198 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP62P37198 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP62P37198 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP62P37198 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP62P37198 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP62P37198 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP62P37198 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP62P37198 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP62P37198 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP62P37198 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP62P37198 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP62P37198 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP62P37198 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP62P37198 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP62P37198 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP62P37198 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP62P37198 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP62P37198 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP62P37198 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP62P37198 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP62P37198 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP62P37198 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP62P37198 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP62P37198 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP62P37198 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP62P37198 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP62P37198 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP62P37198 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP62P37198 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP62P37198 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP62P37198 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP62P37198 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP62P37198 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP62P37198 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP62P37198 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP62P37198 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP62P37198 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP62P37198 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP62P37198 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP62P37198 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP62P37198 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP62P37198 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP62P37198 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP62P37198 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP62P37198 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP62P37198 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP62P37198 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP62P37198 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms