Protein–RNA interactions for Protein: P37088

SCNN1A, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1AP37088 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCNN1AP37088 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCNN1AP37088 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCNN1AP37088 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCNN1AP37088 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCNN1AP37088 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCNN1AP37088 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCNN1AP37088 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCNN1AP37088 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1AP37088 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1AP37088 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1AP37088 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1AP37088 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1AP37088 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms