Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL4P36578 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL4P36578 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL4P36578 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL4P36578 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL4P36578 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL4P36578 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL4P36578 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL4P36578 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL4P36578 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL4P36578 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL4P36578 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL4P36578 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL4P36578 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL4P36578 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL4P36578 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL4P36578 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL4P36578 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL4P36578 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL4P36578 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL4P36578 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL4P36578 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL4P36578 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL4P36578 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL4P36578 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL4P36578 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL4P36578 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL4P36578 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL4P36578 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL4P36578 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL4P36578 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL4P36578 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL4P36578 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL4P36578 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL4P36578 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL4P36578 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL4P36578 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL4P36578 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL4P36578 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL4P36578 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL4P36578 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL4P36578 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL4P36578 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL4P36578 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL4P36578 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL4P36578 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL4P36578 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL4P36578 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL4P36578 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL4P36578 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL4P36578 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL4P36578 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL4P36578 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL4P36578 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL4P36578 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL4P36578 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL4P36578 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL4P36578 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL4P36578 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL4P36578 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL4P36578 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPL4P36578 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL4P36578 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL4P36578 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL4P36578 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL4P36578 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL4P36578 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL4P36578 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL4P36578 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL4P36578 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL4P36578 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL4P36578 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL4P36578 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL4P36578 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL4P36578 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL4P36578 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL4P36578 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL4P36578 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL4P36578 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL4P36578 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL4P36578 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL4P36578 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL4P36578 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL4P36578 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL4P36578 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL4P36578 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL4P36578 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL4P36578 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL4P36578 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL4P36578 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL4P36578 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL4P36578 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL4P36578 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL4P36578 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL4P36578 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL4P36578 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL4P36578 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL4P36578 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL4P36578 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL4P36578 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms