Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN2P35609 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms