Protein–RNA interactions for Protein: P35442

THBS2, Thrombospondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS2P35442 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS2P35442 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS2P35442 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS2P35442 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS2P35442 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS2P35442 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS2P35442 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS2P35442 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS2P35442 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
THBS2P35442 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
THBS2P35442 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THBS2P35442 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THBS2P35442 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THBS2P35442 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THBS2P35442 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THBS2P35442 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THBS2P35442 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THBS2P35442 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THBS2P35442 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THBS2P35442 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THBS2P35442 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS2P35442 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS2P35442 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS2P35442 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS2P35442 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS2P35442 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS2P35442 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS2P35442 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS2P35442 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS2P35442 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THBS2P35442 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THBS2P35442 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THBS2P35442 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THBS2P35442 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THBS2P35442 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THBS2P35442 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
THBS2P35442 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THBS2P35442 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THBS2P35442 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS2P35442 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS2P35442 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS2P35442 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS2P35442 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS2P35442 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS2P35442 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS2P35442 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS2P35442 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THBS2P35442 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
THBS2P35442 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
THBS2P35442 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THBS2P35442 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THBS2P35442 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THBS2P35442 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THBS2P35442 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THBS2P35442 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THBS2P35442 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THBS2P35442 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THBS2P35442 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
THBS2P35442 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THBS2P35442 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THBS2P35442 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THBS2P35442 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THBS2P35442 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS2P35442 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS2P35442 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS2P35442 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS2P35442 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS2P35442 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS2P35442 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS2P35442 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS2P35442 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS2P35442 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS2P35442 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS2P35442 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS2P35442 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS2P35442 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS2P35442 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS2P35442 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS2P35442 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS2P35442 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS2P35442 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS2P35442 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS2P35442 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS2P35442 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS2P35442 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS2P35442 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS2P35442 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS2P35442 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS2P35442 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS2P35442 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS2P35442 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS2P35442 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS2P35442 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS2P35442 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS2P35442 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS2P35442 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
THBS2P35442 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
THBS2P35442 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.32■■□□□ 1
THBS2P35442 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THBS2P35442 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms