Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BMI1P35226 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BMI1P35226 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BMI1P35226 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BMI1P35226 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BMI1P35226 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BMI1P35226 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BMI1P35226 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BMI1P35226 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BMI1P35226 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BMI1P35226 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BMI1P35226 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BMI1P35226 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BMI1P35226 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BMI1P35226 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BMI1P35226 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BMI1P35226 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BMI1P35226 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BMI1P35226 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BMI1P35226 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BMI1P35226 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BMI1P35226 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BMI1P35226 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BMI1P35226 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BMI1P35226 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BMI1P35226 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BMI1P35226 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BMI1P35226 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BMI1P35226 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BMI1P35226 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BMI1P35226 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BMI1P35226 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BMI1P35226 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BMI1P35226 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BMI1P35226 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BMI1P35226 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BMI1P35226 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BMI1P35226 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BMI1P35226 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BMI1P35226 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BMI1P35226 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BMI1P35226 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BMI1P35226 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BMI1P35226 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BMI1P35226 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BMI1P35226 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BMI1P35226 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BMI1P35226 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BMI1P35226 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BMI1P35226 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BMI1P35226 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BMI1P35226 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BMI1P35226 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BMI1P35226 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BMI1P35226 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BMI1P35226 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BMI1P35226 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BMI1P35226 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BMI1P35226 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BMI1P35226 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BMI1P35226 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BMI1P35226 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BMI1P35226 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BMI1P35226 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BMI1P35226 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BMI1P35226 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BMI1P35226 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BMI1P35226 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BMI1P35226 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BMI1P35226 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BMI1P35226 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BMI1P35226 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BMI1P35226 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BMI1P35226 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BMI1P35226 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BMI1P35226 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BMI1P35226 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BMI1P35226 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BMI1P35226 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BMI1P35226 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BMI1P35226 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BMI1P35226 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BMI1P35226 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BMI1P35226 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BMI1P35226 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BMI1P35226 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BMI1P35226 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BMI1P35226 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BMI1P35226 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BMI1P35226 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BMI1P35226 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BMI1P35226 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BMI1P35226 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BMI1P35226 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BMI1P35226 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BMI1P35226 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BMI1P35226 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BMI1P35226 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BMI1P35226 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BMI1P35226 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2836.1 ms