Protein–RNA interactions for Protein: P32971

TNFSF8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF8P32971 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF8P32971 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF8P32971 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms