Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP1P32455 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP1P32455 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP1P32455 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP1P32455 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP1P32455 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP1P32455 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP1P32455 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP1P32455 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP1P32455 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP1P32455 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP1P32455 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP1P32455 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP1P32455 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP1P32455 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP1P32455 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP1P32455 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP1P32455 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP1P32455 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP1P32455 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP1P32455 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP1P32455 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP1P32455 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP1P32455 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP1P32455 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP1P32455 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP1P32455 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP1P32455 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP1P32455 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP1P32455 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP1P32455 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP1P32455 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP1P32455 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP1P32455 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP1P32455 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP1P32455 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP1P32455 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP1P32455 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP1P32455 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP1P32455 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP1P32455 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP1P32455 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP1P32455 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP1P32455 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP1P32455 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP1P32455 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP1P32455 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP1P32455 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP1P32455 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP1P32455 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP1P32455 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP1P32455 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP1P32455 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP1P32455 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP1P32455 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP1P32455 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP1P32455 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP1P32455 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP1P32455 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP1P32455 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP1P32455 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP1P32455 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP1P32455 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP1P32455 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP1P32455 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP1P32455 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GBP1P32455 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP1P32455 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP1P32455 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP1P32455 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP1P32455 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP1P32455 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP1P32455 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP1P32455 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP1P32455 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP1P32455 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP1P32455 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP1P32455 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP1P32455 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP1P32455 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP1P32455 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP1P32455 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP1P32455 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP1P32455 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP1P32455 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP1P32455 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP1P32455 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP1P32455 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP1P32455 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP1P32455 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP1P32455 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP1P32455 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP1P32455 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP1P32455 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP1P32455 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP1P32455 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP1P32455 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP1P32455 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP1P32455 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP1P32455 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms