Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNGA1P29973 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGA1P29973 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNGA1P29973 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CNGA1P29973 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNGA1P29973 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNGA1P29973 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNGA1P29973 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CNGA1P29973 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CNGA1P29973 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNGA1P29973 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNGA1P29973 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNGA1P29973 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNGA1P29973 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNGA1P29973 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNGA1P29973 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CNGA1P29973 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGA1P29973 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CNGA1P29973 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms