Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRABP1P29762 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms