Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID4AP29374 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID4AP29374 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID4AP29374 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID4AP29374 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID4AP29374 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID4AP29374 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID4AP29374 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARID4AP29374 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARID4AP29374 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARID4AP29374 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID4AP29374 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARID4AP29374 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARID4AP29374 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID4AP29374 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID4AP29374 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID4AP29374 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms