Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBL1P28749 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBL1P28749 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBL1P28749 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBL1P28749 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBL1P28749 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBL1P28749 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBL1P28749 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBL1P28749 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBL1P28749 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBL1P28749 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBL1P28749 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RBL1P28749 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBL1P28749 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBL1P28749 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBL1P28749 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBL1P28749 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBL1P28749 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBL1P28749 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBL1P28749 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBL1P28749 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBL1P28749 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBL1P28749 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBL1P28749 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBL1P28749 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBL1P28749 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBL1P28749 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBL1P28749 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBL1P28749 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBL1P28749 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBL1P28749 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBL1P28749 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBL1P28749 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBL1P28749 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBL1P28749 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBL1P28749 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBL1P28749 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBL1P28749 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RBL1P28749 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBL1P28749 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBL1P28749 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RBL1P28749 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBL1P28749 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBL1P28749 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBL1P28749 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBL1P28749 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBL1P28749 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBL1P28749 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBL1P28749 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBL1P28749 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBL1P28749 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBL1P28749 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RBL1P28749 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBL1P28749 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBL1P28749 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBL1P28749 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBL1P28749 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBL1P28749 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBL1P28749 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBL1P28749 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBL1P28749 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBL1P28749 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBL1P28749 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBL1P28749 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBL1P28749 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBL1P28749 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBL1P28749 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBL1P28749 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RBL1P28749 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBL1P28749 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RBL1P28749 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBL1P28749 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBL1P28749 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBL1P28749 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBL1P28749 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBL1P28749 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBL1P28749 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBL1P28749 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBL1P28749 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBL1P28749 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBL1P28749 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBL1P28749 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBL1P28749 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBL1P28749 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RBL1P28749 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBL1P28749 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RBL1P28749 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBL1P28749 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBL1P28749 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBL1P28749 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBL1P28749 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBL1P28749 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBL1P28749 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBL1P28749 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBL1P28749 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBL1P28749 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBL1P28749 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBL1P28749 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBL1P28749 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBL1P28749 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms