Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BCKDHBP21953 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BCKDHBP21953 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCKDHBP21953 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms