Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA2P20248 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCNA2P20248 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms