Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGB6P18564 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB6P18564 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.1 ms