Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PDE6GP18545 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PDE6GP18545 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PDE6GP18545 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PDE6GP18545 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PDE6GP18545 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PDE6GP18545 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PDE6GP18545 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PDE6GP18545 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PDE6GP18545 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PDE6GP18545 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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PDE6GP18545 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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