Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VCLP18206 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCLP18206 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCLP18206 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCLP18206 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCLP18206 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCLP18206 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCLP18206 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VCLP18206 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCLP18206 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCLP18206 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VCLP18206 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCLP18206 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCLP18206 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCLP18206 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCLP18206 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCLP18206 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCLP18206 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCLP18206 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCLP18206 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCLP18206 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCLP18206 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCLP18206 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCLP18206 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCLP18206 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCLP18206 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCLP18206 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCLP18206 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCLP18206 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCLP18206 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCLP18206 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCLP18206 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCLP18206 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCLP18206 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCLP18206 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCLP18206 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCLP18206 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCLP18206 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCLP18206 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VCLP18206 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCLP18206 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCLP18206 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCLP18206 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCLP18206 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCLP18206 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCLP18206 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCLP18206 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCLP18206 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VCLP18206 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCLP18206 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCLP18206 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCLP18206 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
VCLP18206 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCLP18206 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VCLP18206 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCLP18206 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCLP18206 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCLP18206 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCLP18206 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCLP18206 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCLP18206 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCLP18206 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCLP18206 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCLP18206 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCLP18206 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCLP18206 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VCLP18206 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCLP18206 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCLP18206 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCLP18206 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCLP18206 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCLP18206 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCLP18206 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCLP18206 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCLP18206 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCLP18206 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCLP18206 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCLP18206 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCLP18206 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VCLP18206 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCLP18206 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCLP18206 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCLP18206 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCLP18206 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCLP18206 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCLP18206 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCLP18206 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCLP18206 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCLP18206 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCLP18206 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VCLP18206 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VCLP18206 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCLP18206 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCLP18206 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCLP18206 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCLP18206 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCLP18206 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCLP18206 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCLP18206 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCLP18206 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms