Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN2P17706 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN2P17706 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms