Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL7RP16871 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL7RP16871 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL7RP16871 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL7RP16871 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL7RP16871 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL7RP16871 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL7RP16871 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL7RP16871 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL7RP16871 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL7RP16871 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL7RP16871 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL7RP16871 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL7RP16871 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL7RP16871 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL7RP16871 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL7RP16871 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL7RP16871 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL7RP16871 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL7RP16871 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL7RP16871 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL7RP16871 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL7RP16871 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL7RP16871 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IL7RP16871 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL7RP16871 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IL7RP16871 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IL7RP16871 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IL7RP16871 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IL7RP16871 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
IL7RP16871 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IL7RP16871 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IL7RP16871 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IL7RP16871 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IL7RP16871 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IL7RP16871 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IL7RP16871 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL7RP16871 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL7RP16871 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL7RP16871 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL7RP16871 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL7RP16871 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL7RP16871 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL7RP16871 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL7RP16871 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL7RP16871 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL7RP16871 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL7RP16871 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL7RP16871 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL7RP16871 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL7RP16871 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL7RP16871 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL7RP16871 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL7RP16871 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL7RP16871 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL7RP16871 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL7RP16871 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL7RP16871 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL7RP16871 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL7RP16871 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL7RP16871 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IL7RP16871 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IL7RP16871 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IL7RP16871 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IL7RP16871 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IL7RP16871 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IL7RP16871 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IL7RP16871 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IL7RP16871 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IL7RP16871 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IL7RP16871 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IL7RP16871 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IL7RP16871 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IL7RP16871 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IL7RP16871 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IL7RP16871 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IL7RP16871 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IL7RP16871 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IL7RP16871 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IL7RP16871 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IL7RP16871 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IL7RP16871 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IL7RP16871 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IL7RP16871 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IL7RP16871 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IL7RP16871 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IL7RP16871 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IL7RP16871 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IL7RP16871 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IL7RP16871 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IL7RP16871 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IL7RP16871 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IL7RP16871 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IL7RP16871 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IL7RP16871 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IL7RP16871 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IL7RP16871 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IL7RP16871 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IL7RP16871 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IL7RP16871 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms